Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS6KB2Q9UBS0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KB2Q9UBS0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KB2Q9UBS0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB2Q9UBS0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms