Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK-18Q9QC07 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVK-18Q9QC07 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVK-18Q9QC07 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVK-18Q9QC07 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVK-18Q9QC07 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVK-18Q9QC07 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-18Q9QC07 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-18Q9QC07 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-18Q9QC07 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVK-18Q9QC07 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms