Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOP53Q9NZM5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOP53Q9NZM5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP53Q9NZM5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOP53Q9NZM5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP53Q9NZM5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP53Q9NZM5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP53Q9NZM5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP53Q9NZM5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms