Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PODXL2Q9NZ53 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PODXL2Q9NZ53 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PODXL2Q9NZ53 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PODXL2Q9NZ53 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PODXL2Q9NZ53 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 746.3 ms