Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
FANCIQ9NVI1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FANCIQ9NVI1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FANCIQ9NVI1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FANCIQ9NVI1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.77■■■■□ 3
FANCIQ9NVI1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FANCIQ9NVI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
FANCIQ9NVI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FANCIQ9NVI1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
FANCIQ9NVI1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
FANCIQ9NVI1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
FANCIQ9NVI1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
FANCIQ9NVI1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
FANCIQ9NVI1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FANCIQ9NVI1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FANCIQ9NVI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FANCIQ9NVI1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms