Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC4BQ9NT99 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC4BQ9NT99 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC4BQ9NT99 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC4BQ9NT99 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC4BQ9NT99 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC4BQ9NT99 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRC4BQ9NT99 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC4BQ9NT99 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRRC4BQ9NT99 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC4BQ9NT99 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
LRRC4BQ9NT99 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC4BQ9NT99 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC4BQ9NT99 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC4BQ9NT99 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms