Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
STRN4Q9NRL3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
STRN4Q9NRL3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
STRN4Q9NRL3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
STRN4Q9NRL3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
STRN4Q9NRL3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
STRN4Q9NRL3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
STRN4Q9NRL3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
STRN4Q9NRL3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
STRN4Q9NRL3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
STRN4Q9NRL3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
STRN4Q9NRL3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
STRN4Q9NRL3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
STRN4Q9NRL3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
STRN4Q9NRL3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
STRN4Q9NRL3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
STRN4Q9NRL3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
STRN4Q9NRL3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
STRN4Q9NRL3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
STRN4Q9NRL3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
STRN4Q9NRL3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
STRN4Q9NRL3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms