Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL2

RRAGD, Ras-related GTP-binding protein D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGDQ9NQL2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRAGDQ9NQL2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRAGDQ9NQL2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRAGDQ9NQL2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRAGDQ9NQL2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRAGDQ9NQL2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGDQ9NQL2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGDQ9NQL2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRAGDQ9NQL2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGDQ9NQL2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGDQ9NQL2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGDQ9NQL2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGDQ9NQL2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms