Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP3Q9NQ35 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP3Q9NQ35 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NRIP3Q9NQ35 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP3Q9NQ35 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms