Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM9BQ9NQ34 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM9BQ9NQ34 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM9BQ9NQ34 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM9BQ9NQ34 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms