Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB9Q9NP78 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCB9Q9NP78 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB9Q9NP78 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB9Q9NP78 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms