Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC98

NEK6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6Q9HC98 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEK6Q9HC98 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK6Q9HC98 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK6Q9HC98 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms