Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMURF2Q9HAU4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMURF2Q9HAU4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMURF2Q9HAU4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMURF2Q9HAU4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms