Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6W3

RIOX1, Ribosomal oxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX1Q9H6W3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RIOX1Q9H6W3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RIOX1Q9H6W3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RIOX1Q9H6W3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIOX1Q9H6W3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIOX1Q9H6W3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIOX1Q9H6W3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIOX1Q9H6W3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RIOX1Q9H6W3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms