Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MTIF3Q9H2K0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTIF3Q9H2K0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTIF3Q9H2K0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTIF3Q9H2K0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTIF3Q9H2K0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MTIF3Q9H2K0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MTIF3Q9H2K0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MTIF3Q9H2K0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTIF3Q9H2K0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTIF3Q9H2K0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTIF3Q9H2K0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTIF3Q9H2K0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTIF3Q9H2K0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms