Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
REXO4Q9GZR2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
REXO4Q9GZR2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO4Q9GZR2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms