Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPO4Q9C0E2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPO4Q9C0E2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
XPO4Q9C0E2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPO4Q9C0E2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPO4Q9C0E2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPO4Q9C0E2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPO4Q9C0E2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 875.4 ms