Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPRY4Q9C004 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRY4Q9C004 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPRY4Q9C004 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPRY4Q9C004 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms