Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
JAM3Q9BX67 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
JAM3Q9BX67 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
JAM3Q9BX67 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
JAM3Q9BX67 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
JAM3Q9BX67 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
JAM3Q9BX67 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms