Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDCA7Q9BWT1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDCA7Q9BWT1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CDCA7Q9BWT1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CDCA7Q9BWT1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDCA7Q9BWT1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDCA7Q9BWT1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CDCA7Q9BWT1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDCA7Q9BWT1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CDCA7Q9BWT1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDCA7Q9BWT1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CDCA7Q9BWT1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CDCA7Q9BWT1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CDCA7Q9BWT1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDCA7Q9BWT1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CDCA7Q9BWT1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CDCA7Q9BWT1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CDCA7Q9BWT1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDCA7Q9BWT1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDCA7Q9BWT1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CDCA7Q9BWT1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CDCA7Q9BWT1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188 ms