Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC106Q9BWC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC106Q9BWC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC106Q9BWC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC106Q9BWC9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC106Q9BWC9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms