Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM56Q9BRZ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM56Q9BRZ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM56Q9BRZ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRIM56Q9BRZ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM56Q9BRZ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM56Q9BRZ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM56Q9BRZ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM56Q9BRZ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM56Q9BRZ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM56Q9BRZ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM56Q9BRZ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM56Q9BRZ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms