Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIKE1Q9BRV8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIKE1Q9BRV8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIKE1Q9BRV8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIKE1Q9BRV8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms