Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GINS4Q9BRT9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS4Q9BRT9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINS4Q9BRT9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms