Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ABCA3Q99758 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCA3Q99758 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.2■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCA3Q99758 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCA3Q99758 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ABCA3Q99758 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ABCA3Q99758 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ABCA3Q99758 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms