Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC1Q99614 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC1Q99614 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC1Q99614 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC1Q99614 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms