Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDNQ99608 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDNQ99608 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDNQ99608 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDNQ99608 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDNQ99608 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDNQ99608 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDNQ99608 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDNQ99608 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDNQ99608 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDNQ99608 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDNQ99608 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDNQ99608 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDNQ99608 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDNQ99608 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDNQ99608 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NDNQ99608 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDNQ99608 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDNQ99608 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDNQ99608 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDNQ99608 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDNQ99608 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NDNQ99608 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDNQ99608 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NDNQ99608 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NDNQ99608 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDNQ99608 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDNQ99608 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDNQ99608 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDNQ99608 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDNQ99608 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDNQ99608 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDNQ99608 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDNQ99608 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDNQ99608 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDNQ99608 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDNQ99608 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDNQ99608 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDNQ99608 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDNQ99608 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDNQ99608 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDNQ99608 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDNQ99608 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDNQ99608 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NDNQ99608 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDNQ99608 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDNQ99608 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDNQ99608 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDNQ99608 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDNQ99608 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDNQ99608 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NDNQ99608 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDNQ99608 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDNQ99608 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDNQ99608 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NDNQ99608 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDNQ99608 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDNQ99608 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDNQ99608 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDNQ99608 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDNQ99608 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDNQ99608 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDNQ99608 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NDNQ99608 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDNQ99608 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDNQ99608 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDNQ99608 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDNQ99608 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDNQ99608 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDNQ99608 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDNQ99608 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDNQ99608 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDNQ99608 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDNQ99608 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDNQ99608 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NDNQ99608 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDNQ99608 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDNQ99608 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDNQ99608 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDNQ99608 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDNQ99608 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDNQ99608 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDNQ99608 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NDNQ99608 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDNQ99608 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDNQ99608 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDNQ99608 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDNQ99608 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDNQ99608 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDNQ99608 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDNQ99608 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDNQ99608 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDNQ99608 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NDNQ99608 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDNQ99608 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDNQ99608 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDNQ99608 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDNQ99608 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDNQ99608 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDNQ99608 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms