Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDRT15Q96T59 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDRT15Q96T59 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDRT15Q96T59 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDRT15Q96T59 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDRT15Q96T59 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms