Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC46.72■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC46.71■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC46.71■■■■■ 5.07
RSF1Q96T23 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC46.69■■■■■ 5.06
RSF1Q96T23 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC46.69■■■■■ 5.06
RSF1Q96T23 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
RSF1Q96T23 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
RSF1Q96T23 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.63■■■■■ 5.06
RSF1Q96T23 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
RSF1Q96T23 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
RSF1Q96T23 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
RSF1Q96T23 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
RSF1Q96T23 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
RSF1Q96T23 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
RSF1Q96T23 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC46.61■■■■■ 5.05
RSF1Q96T23 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
RSF1Q96T23 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
RSF1Q96T23 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.58■■■■■ 5.05
RSF1Q96T23 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
RSF1Q96T23 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.55■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC46.54■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.53■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC46.53■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC46.51■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC46.5■■■■■ 5.04
RSF1Q96T23 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC46.5■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.5■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC46.49■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC46.48■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
RSF1Q96T23 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC46.42■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.41■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC46.4■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC46.39■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
RSF1Q96T23 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC46.37■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC46.37■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC46.34■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC46.34■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
RSF1Q96T23 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
RSF1Q96T23 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
RSF1Q96T23 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC46.29■■■■■ 5
RSF1Q96T23 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
RSF1Q96T23 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
RSF1Q96T23 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
RSF1Q96T23 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
RSF1Q96T23 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
RSF1Q96T23 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
RSF1Q96T23 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC46.27■■■■■ 5
RSF1Q96T23 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC46.26■■■■■ 5
RSF1Q96T23 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
RSF1Q96T23 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
RSF1Q96T23 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
RSF1Q96T23 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
RSF1Q96T23 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
RSF1Q96T23 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
RSF1Q96T23 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
RSF1Q96T23 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms