Protein–RNA interactions for Protein: Q96RN5

MED15, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED15Q96RN5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED15Q96RN5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MED15Q96RN5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED15Q96RN5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MED15Q96RN5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MED15Q96RN5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms