Protein–RNA interactions for Protein: Q96RN1

SLC26A8, Testis anion transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A8Q96RN1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SLC26A8Q96RN1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SLC26A8Q96RN1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SLC26A8Q96RN1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SLC26A8Q96RN1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
SLC26A8Q96RN1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SLC26A8Q96RN1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SLC26A8Q96RN1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SLC26A8Q96RN1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SLC26A8Q96RN1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms