Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CITED4Q96RK1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CITED4Q96RK1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CITED4Q96RK1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms