Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARXQ96QS3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARXQ96QS3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARXQ96QS3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARXQ96QS3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARXQ96QS3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARXQ96QS3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ARXQ96QS3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
ARXQ96QS3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARXQ96QS3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARXQ96QS3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms