Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PGLYRP2Q96PD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGLYRP2Q96PD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGLYRP2Q96PD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PGLYRP2Q96PD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGLYRP2Q96PD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms