Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01600Q96MT4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01600Q96MT4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01600Q96MT4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01600Q96MT4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01600Q96MT4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01600Q96MT4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01600Q96MT4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01600Q96MT4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01600Q96MT4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01600Q96MT4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC01600Q96MT4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01600Q96MT4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01600Q96MT4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms