Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC138Q96M89 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC138Q96M89 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC138Q96M89 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC138Q96M89 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1426.5 ms