Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC7Q96M83 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC7Q96M83 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC7Q96M83 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CCDC7Q96M83 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCDC7Q96M83 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC7Q96M83 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCDC7Q96M83 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC7Q96M83 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CCDC7Q96M83 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCDC7Q96M83 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC7Q96M83 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC7Q96M83 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC7Q96M83 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CCDC7Q96M83 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC7Q96M83 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC7Q96M83 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC7Q96M83 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms