Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC34Q96HJ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC34Q96HJ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC34Q96HJ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC34Q96HJ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms