Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SGF29Q96ES7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGF29Q96ES7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGF29Q96ES7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGF29Q96ES7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms