Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXNL1Q96CM4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NXNL1Q96CM4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NXNL1Q96CM4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXNL1Q96CM4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NXNL1Q96CM4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NXNL1Q96CM4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NXNL1Q96CM4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NXNL1Q96CM4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXNL1Q96CM4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXNL1Q96CM4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXNL1Q96CM4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXNL1Q96CM4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXNL1Q96CM4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXNL1Q96CM4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms