Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C12orf43Q96C57 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C12orf43Q96C57 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C12orf43Q96C57 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf43Q96C57 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms