Protein–RNA interactions for Protein: Q96A99

PTX4, Pentraxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4Q96A99 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX4Q96A99 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX4Q96A99 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX4Q96A99 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTX4Q96A99 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTX4Q96A99 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTX4Q96A99 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTX4Q96A99 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTX4Q96A99 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTX4Q96A99 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTX4Q96A99 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTX4Q96A99 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTX4Q96A99 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PTX4Q96A99 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX4Q96A99 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX4Q96A99 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX4Q96A99 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX4Q96A99 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX4Q96A99 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTX4Q96A99 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX4Q96A99 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX4Q96A99 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTX4Q96A99 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms