Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TCEAL3Q969E4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
TCEAL3Q969E4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCEAL3Q969E4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEAL3Q969E4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms