Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX13Q92968 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX13Q92968 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX13Q92968 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX13Q92968 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX13Q92968 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms