Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RABGGTAQ92696 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABGGTAQ92696 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABGGTAQ92696 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABGGTAQ92696 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGGTAQ92696 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGGTAQ92696 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGGTAQ92696 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGGTAQ92696 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
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