Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC9Q92623 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC9Q92623 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC9Q92623 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms