Protein–RNA interactions for Protein: Q92604

LPGAT1, Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPGAT1Q92604 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LPGAT1Q92604 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPGAT1Q92604 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPGAT1Q92604 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms