Protein–RNA interactions for Protein: Q92523

CPT1B, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPT1BQ92523 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPT1BQ92523 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CPT1BQ92523 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPT1BQ92523 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPT1BQ92523 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPT1BQ92523 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms