Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATL1Q8WXF7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATL1Q8WXF7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATL1Q8WXF7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATL1Q8WXF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATL1Q8WXF7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms