Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWG9

KCNE4, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 4, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE4Q8WWG9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNE4Q8WWG9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNE4Q8WWG9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNE4Q8WWG9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNE4Q8WWG9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms